超高速並列処理による次世代シーケンサ結果解析技術の開発

研究課題

研究代表者	明石浩史札幌医科大学, 附属総合情報センター, 講師
研究期間 (年度)	2009
概要	次世代シーケンサ等の生物学データの量的・質的な増大に対応するために、大量の配列タグデータをゲノム配列へ超高速でマッピングするシステムを国産並列処理OS・SSS-PCを用いて構築する。OSレベルの高速並列処理により超高速処理が可能なSSS-PC 上でDNA配列解析ソフトウエアの設計、既存ゲノムビューアの移植、独自可視化ビューアと解析インタフェースを開発し、大量のDNA配列情報の超ハイスループット解析への対応を可能にする。