| 概要 | 本研究の目的は、深海底熱水活動域に棲息する微生物の糖鎖関連遺伝子群を網羅的に取得することにある。現場に普遍的に優占する微生物のゲノム情報に基づき、糖鎖関連遺伝子群のクラスターを増幅するためのプライマーセットを設計した。中部沖縄トラフの深海底熱水活動域(水深約1,000m)において採取した試料から環境DNAを抽出し、糖鎖関連遺伝子群をターゲットとするロングPCRを行なった。予想されるサイズの増幅産物が得られたため、ディープシーケンシング解析するためのフラグメントライブラリーの作製(断片化しアダプターを付加する)を試みた。その段階において解析に必要なビーズが回収されず、予算の範囲内で考えられるあらゆる手段を尽くしたが、ライブラリーの作製に至らなかった。
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