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深海底熱水活動域に棲息する共生微生物群が有する新規糖転移酵素群: 地球最大のレアバイオスフェアに眠る未開拓資源の網羅的開発

研究課題

産学が連携した研究開発成果の展開 研究成果展開事業 研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP) 探索タイプ

研究責任者 中川 聡  北海道大学, 水産科学研究科(研究院), 准教授
研究期間 (年度) 2010
概要本研究の目的は、深海底熱水活動域に棲息する微生物の糖鎖関連遺伝子群を網羅的に取得することにある。現場に普遍的に優占する微生物のゲノム情報に基づき、糖鎖関連遺伝子群のクラスターを増幅するためのプライマーセットを設計した。中部沖縄トラフの深海底熱水活動域(水深約1,000m)において採取した試料から環境DNAを抽出し、糖鎖関連遺伝子群をターゲットとするロングPCRを行なった。予想されるサイズの増幅産物が得られたため、ディープシーケンシング解析するためのフラグメントライブラリーの作製(断片化しアダプターを付加する)を試みた。その段階において解析に必要なビーズが回収されず、予算の範囲内で考えられるあらゆる手段を尽くしたが、ライブラリーの作製に至らなかった。

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JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2016-04-26   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2025-03-26  

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