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機械学習を用いたタンパク質-リガンド結合部位予測ツールの自動生成パイプラインの開発

研究課題

知識インフラの構築 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

研究代表者

番野 雅城  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 大学院生

研究期間 (年度) 2013
概要利用者が指定したリガンド(糖、脂質、金属イオンなど)に対し、そのリガンドが結合するタンパク質の部位(リガンド結合部位)を予測するツールの自動生成パイプラインを開発する。すでに開発したリガンド結合部位データベースにほかの最新データを統合することで、機械学習に基づく高精度な予測ツールを生成する。生成される予測ツールは立体構造未知なタンパク質も予測可能で計算コストも小さく、ゲノムワイドな予測が可能である。
研究領域統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

報告書

(1件)
  • 2013 終了報告書 ( PDF )

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2015-09-30   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2025-03-26  

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