機械学習を用いたタンパク質-リガンド結合部位予測ツールの自動生成パイプラインの開発
研究代表者 |
番野 雅城 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 大学院生
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研究期間 (年度) |
2013
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概要 | 利用者が指定したリガンド(糖、脂質、金属イオンなど)に対し、そのリガンドが結合するタンパク質の部位(リガンド結合部位)を予測するツールの自動生成パイプラインを開発する。すでに開発したリガンド結合部位データベースにほかの最新データを統合することで、機械学習に基づく高精度な予測ツールを生成する。生成される予測ツールは立体構造未知なタンパク質も予測可能で計算コストも小さく、ゲノムワイドな予測が可能である。
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研究領域 | 統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル) |