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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発

研究課題

知識インフラの構築 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

研究代表者

藤井 聡  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 助教

研究期間 (年度) 2013
概要現在、さまざまなデータベースが公開されているが、それらをいかにつなぎあわせて有用な情報を引き出すかが課題となっている。そこで本研究では、それらの情報同士の共起関係に注目し、重要な関係性を探索する手法を開発する。今回は機能ドメイン・モチーフに対して共起関係を求めていく。その共起関係は3次元構造上近くに存在するもの、全タンパク質中で高頻度に出現するもの、またその両方に当てはまるものを検出する。これらで得られた重要な共起関係はデータベースにしてWebツールとして公開する。
研究領域統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

報告書

(1件)
  • 2013 終了報告書 ( PDF )

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2015-09-30   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2025-03-26  

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