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PDBjタンパク質をゲノムにマップしたpdbBAMの作成

研究課題

知識インフラの構築 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

研究代表者

城田 松之  東北大学, 大学院医学系研究科, 助教

研究期間 (年度) 2014
概要本研究では、PDBjに含まれる立体構造が解析されたタンパク質のアミノ酸配列について対応するmRNA配列に変換した後、ヒトゲノムDNA配列にマッピングし、ゲノム上の位置と変異情報を示すpdbBAMファイルを構築する。これにより、個人ゲノム解析結果をゲノムブラウザで閲覧したときに、変異情報と既知の構造情報を一目で把握することを可能にする。本研究は個人ゲノム解析と構造生物学の橋渡しをするものであり、これらの研究成果を個別化医療や創薬に効率的に応用できるツールを目指す。
研究領域統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル)

報告書

(1件)
  • 2014 終了報告書 ( PDF )

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2015-09-30   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2025-03-26  

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