質量分析と統計解析の融合によるメタプロテオミクス

研究課題

体系的番号	JPMJCR1862
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJCR1862
研究代表者	石濱泰京都大学, 薬学研究科, 教授
研究期間 (年度)	2018 – 2023
概要	生命活動を直接担う分子であるタンパク質全体を標的とするプロテオミクスは、生命科学分野を中心に大きな注目を集めています。プロテオミクスにおける質量分析を用いた計測には、LC/MS/MSが用いられます。本研究ではLC/MS/MS計測技術と統計的信号解析技術を双方向から融合させることによりプロテオームの計測・解析技術を深化させ、微生物生態系など複雑な生命系を対象とするメタプロテオミクスを開拓します。
研究領域	計測技術と高度情報処理の融合によるインテリジェント計測・解析手法の開発と応用

報告書

(2件)

2023 事後評価書 ( PDF ) 終了報告書 ( PDF )

主な研究成果
(6件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (6件) (査読あり 6件、オープンアクセス 6件)

[雑誌論文] One thousand samples per day capillary-flow LC/MS/MS for high-speed, high-sensitivity and in-depth proteomics2024
- 著者名
  Tomioka, Ayana and Tomioka, Ryota and Mori, Issei and Isobe, Yosuke and Arita, Makoto and Imami, Koshi and Kanao, Eisuke and Ogata, Kosuke and Ishihama, Yasushi
- 雑誌名
  
  bioRxiv
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] One-step N-terminomics based on isolation of protein N-terminal peptides from LysargiNase digests by tip-based strong cation exchange chromatography.2024
- 著者名
  Kazuya Morikawa, Hiroshi Nishida, Koshi Imami, Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Molecular & cellular proteomics : MCP
  
  ページ: 100820-100820
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Leveraging Pretrained Deep Protein Language Model to Predict Peptide Collision Cross Section2024
- 著者名
  Nakai-Kasai, Ayano and Ogata, Kosuke and Ishihama, Yasushi and Tanaka, Toshiyuki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Quantitation of Host Cell Proteins by Capillary LC/IMS/MS/MS in Combination with Rapid Digestion on Immobilized Trypsin Column Under Native Conditions2024
- 著者名
  Tomioka R, Ogata K, Ishihama Y.
- 雑誌名
  
  Mass Spectrom (Tokyo)
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 0152
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Revisiting Protein Reversed-Phase Chromatography for Bottom-Up Proteomics.2024
- 著者名
  Shunsuke Takagi, Nobuyuki Suzuki, Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Journal of proteome research
  
  巻: 23 号: 10 ページ: 4704-4714
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] High-Recovery Desalting Tip Columns for a Wide Variety of Peptides in Mass Spectrometry-based Proteomics2024
- 著者名
  Eisuke Kanao, Shunsuke Tanaka, Ayana Tomioka, Tetsuya Tanigawa, Takuya Kubo, Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Analytical chemistry
- 査読あり / オープンアクセス

質量分析と統計解析の融合によるメタプロテオミクス

研究代表者

石濱 泰 京都大学, 薬学研究科, 教授

報告書

主な研究成果

[雑誌論文] One thousand samples per day capillary-flow LC/MS/MS for high-speed, high-sensitivity and in-depth proteomics2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] One-step N-terminomics based on isolation of protein N-terminal peptides from LysargiNase digests by tip-based strong cation exchange chromatography.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Leveraging Pretrained Deep Protein Language Model to Predict Peptide Collision Cross Section2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Quantitation of Host Cell Proteins by Capillary LC/IMS/MS/MS in Combination with Rapid Digestion on Immobilized Trypsin Column Under Native Conditions2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Revisiting Protein Reversed-Phase Chromatography for Bottom-Up Proteomics.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] High-Recovery Desalting Tip Columns for a Wide Variety of Peptides in Mass Spectrometry-based Proteomics2024

著者名

雑誌名

石濱泰京都大学, 薬学研究科, 教授