自己再生産し進化する人工ゲノム複製・転写・翻訳システムの開発

研究課題

戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST

体系的番号	JPMJCR20S1
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJCR20S1
研究代表者	市橋伯一東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授
研究期間 (年度)	2020 – 2025
概要	本研究では、リボソームを除く必要なすべての遺伝子（36個）について自己再生産するDNA複製・転写・翻訳システムの開発を行います。この目標を実現可能なものとするために、独自に開発した単純化したDNA複製システムと進化のしくみを用いたDNA配列最適化手法を用います。この目的が達成されれば、増える人工細胞の実現が夢ではなくなるはずです。
研究領域	ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出

主な研究成果
(4件)

すべて雑誌論文 (4件) (国際共著 1件、査読あり 4件、オープンアクセス 4件)

[雑誌論文] MLm5C: a high-precision human RNA 5-methylcytosine sites predictor based on a combination of hybrid machine learning models2024
- 著者名
  Hiroyuki Kurata, Md. Harun-Or-Roshid, Md Mehedi Hasan, Sho Tsukiyama, Kazuhiro Maeda, Balachandran Manavalan
- 雑誌名
  
  Methods
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
[雑誌論文] PredIL13: stacking a variety of machine and deep learning methods with ESM-2 language model for identifying IL13-inducing peptides2024
- 著者名
  Hiroyuki Kurata, Md. Harun-Or-Roshid, Sho Tsukiyama, Kazuhiro Maeda
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Mutagenic effects of ultraviolet radiation and trimethyl psoralen in mycoplasma toward a minimal genome.2024
- 著者名
  Kaito Seo, Kensei Okada, Norikazu Ichihashi
- 雑誌名
  
  Genes & genetic systems
  
  巻: 99
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Wireframe DNA Origami Capable of Vertex-protruding Transformation2024
- 著者名
  Yosuke Ochi, Wataru Kato, Yoichi Tsutsui, Yuki Gomibuchi, Daichi Tominaga, Keisuke Sakai, Takeshi Araki, Suzunosuke Yoshitake, Takuo Yasunaga, Yusuke V. Morimoto, Kazuhiro Maeda, Junichi Taira, and Yusuke Sato
- 雑誌名
  
  Chembiochem
- 査読あり / オープンアクセス