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深層学習を用いたゲノムスタイル特徴抽出とDNA配列de novo設計と合成

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 CREST

体系的番号 JPMJCR20S3
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJCR20S3

研究代表者

榊原 康文  慶應義塾大学, 理工学部, 教授

研究期間 (年度) 2020 – 2025
概要深層学習技術を用いてDNA一次配列を設計・生成する手法を開発し,合成したDNAを細胞に導入し,機能発現を検証する研究を実施する.ゲノムスタイルという新しい視点を導入し,遺伝情報は保持したままゲノムの書き方を変換する方式を開発する.次に,枯草菌を用いたゲノム合成プラットフォームを確立し,そしてPET分解酵素とその代謝経路の遺伝子クラスターを対象として,耐熱性や安定性などの機能改変に応用する.
研究領域ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出
  • 主な研究成果

    (3件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (3件) (査読あり 3件、 オープンアクセス 3件)

  • [雑誌論文] Decoding host-microbiome interactions through co-expression network analysis within the non-human primate intestine2024

    • 著者名
      Uehara M, Inoue T, Hase S, Sasaki E, Toyoda A, Sakakibara Y.
    • 雑誌名

      mSystems

      巻: 16 号: 9

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Integrated conjugal plasmid pLS20 in the Bacillus subtilis genome produced 850-kbp circular subgenomes transmissible to another B. subtilis.2024

    • 著者名
      Itaya M, Kataoka M.
    • 雑誌名

      Genes Cells

      号: 7 ページ: 584-588

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Relationship between oriT length and efficiency of RP4-mediated conjugation from Escherichia coli to Gram-positive bacteria.2024

    • 著者名
      Fukada Y, Inomata S, Kataoka M.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem.

      巻: 89 号: 1 ページ: 133-140

    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2020-12-16   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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