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潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 CREST

体系的番号 JPMJCR20S5
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJCR20S5

研究代表者

平谷 伊智朗  理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー

研究期間 (年度) 2020 – 2025
概要本研究は、哺乳類染色体に潜む不安定性の解明をキーワードに、染色体の動的制御の基盤を明らかにする。核内コンパートメントの制御因子を網羅的探索し、TADとコンパートメントの発生動態と細胞周期動態を明らかにし、これらの人為的構築を試みる。さらに、染色体異数化を抑制する分子機構に迫り、複製困難ゲノム領域を同定し、異数化との関係に迫る。並行して、1細胞全ゲノム解析技術の解像度向上と多次元解析の実現を目指す。
研究領域ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出
  • 主な研究成果

    (15件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (15件) (国際共著 6件、 査読あり 14件、 オープンアクセス 15件)

  • [雑誌論文] Creation of Knock-In Alleles of Insulin Receptor Tagged by Fluorescent Proteins mCherry or EYFP in Fruit Fly Drosophila melanogaster.2024

    • 著者名
      Ayano Moriya, Kei Otsuka, Riku Naoi, Mayu Terahata, Koji Takeda, Shu Kondo, Takashi Adachi-Yamada
    • 雑誌名

      Zoological science

      巻: 41 号: 2 ページ: 230-243

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A humoral stress response protects Drosophila tissues from antimicrobial peptides.2024

    • 著者名
      Samuel Rommelaere, Alexia Carboni, Juan F Bada Juarez, Jean-Philippe Boquete, Luciano A Abriata, Fernando Teixeira Pinto Meireles, Verena Rukes, Crystal Vincent, Shu Kondo, Marc S Dionne, Matteo Dal Peraro, Chan Cao, Bruno Lemaitre
    • 雑誌名

      Current biology : CB

      巻: 34 号: 7 ページ: 1426-1437

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Revealing the Mechanism Underlying 3D‐AFM Imaging of Suspended Structures by Experiments and Simulations2024

    • 著者名
      Mohammad Shahidul Alam, Marcos Penedo, Takashi Sumikama, Keisuke Miyazawa, Kaori Hirahara, Takeshi Fukuma
    • 雑誌名

      Small Methods

      巻: 8 ページ: 2400287

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system.2024

    • 著者名
      Toshiharu Ichinose, Shu Kondo, Mai Kanno, Yuichi Shichino, Mari Mito, Shintaro Iwasaki, Hiromu Tanimoto
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 12

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Embryonic genome instability upon DNA replication timing program emergence2024

    • 著者名
      Takahashi S, Kyogoku H, Hayakawa T, Miura H, Oji A, Kondo Y, Takebayashi SI, Kitajima TS, Hiratani I
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 633 号: 8030 ページ: 686-694

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Fluctuations and Dimer Splitting of the N-Terminal Domain of GluA2 Ionotropic Glutamate Receptor-Auxiliary Subunit Complex2024

    • 著者名
      Ayumi Sumino, Takashi Sumikama, Yimeng Zhao, Holger Flechsig, Kenichi Umeda, Noriyuki Kodera, Hiroki Konno, Motoyuki Hattori, Mikihiro Shibata
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 18 ページ: 25018-25035

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CWL-based analysis pipeline for Hi-C data: from FASTQ files to matrices2024

    • 著者名
      Miura H, Cerbus RT, Noda I, Hiratani I
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 2856 ページ: 79-117

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mettl1-dependent m7G tRNA modification is essential for maintaining spermatogenesis and fertility in Drosophila melanogaster.2024

    • 著者名
      Shunya Kaneko, Keita Miyoshi, Kotaro Tomuro, Makoto Terauchi, Ryoya Tanaka, Shu Kondo, Naoki Tani, Kei-Ichiro Ishiguro, Atsushi Toyoda, Azusa Kamikouchi, Hideki Noguchi, Shintaro Iwasaki, Kuniaki Saito
    • 雑誌名

      Nature communications

      巻: 15 号: 1 ページ: 8147-8147

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SUMOylation of Warts kinase promotes neural stem cell reactivation.2024

    • 著者名
      Yang Gao, Ye Sing Tan, Jiaen Lin, Liang Yuh Chew, Htet Yamin Aung, Brinda Palliyana, Mahekta R Gujar, Kun-Yang Lin, Shu Kondo, Hongyan Wang
    • 雑誌名

      Nature communications

      巻: 15 号: 1 ページ: 8557-8557

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structure and dynamics of nuclear A/B compartments and subcompartments2024

    • 著者名
      Oji A, Choubani L, Miura H, Hiratani I
    • 雑誌名

      Curr Opin Cell Biol

      巻: 90 ページ: 102406

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Homeotic and nonhomeotic patterns in the tetrapod vertebral formula2024

    • 著者名
      Cerbus RT, Hiratani I, Kawaguchi K
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 121 号: 47

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A high-protein diet-responsive gut hormone regulates behavioral and metabolic optimization in Drosophila melanogaster.2024

    • 著者名
      Yuto Yoshinari, Takashi Nishimura, Taishi Yoshii, Shu Kondo, Hiromu Tanimoto, Tomoe Kobayashi, Makoto Matsuyama, Ryusuke Niwa
    • 雑誌名

      Nature communications

      巻: 15 号: 1 ページ: 10819-10819

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Synaptic enrichment and dynamic regulation of the two opposing dopamine receptors within the same neurons.2024

    • 著者名
      Shun Hiramatsu, Kokoro Saito, Shu Kondo, Hidetaka Katow, Nobuhiro Yamagata, Chun-Fang Wu, Hiromu Tanimoto
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 13

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Trisomic rescue via allele-specific multiple chromosome cleavage using CRISPR-Cas9 in trisomy 21 cells2024

    • 著者名
      Hashizume R, Wakita S, Sawada H, Takebayashi SI, Kitabatake Y, Miyagawa Y, Hirokawa YS, Imai H, Kurahashi H
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 4 号: 2

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A new Drosophila melanogaster research resource: CRISPR-induced mutations for clonal analysis of fourth chromosome genes.2024

    • 著者名
      Bonnie M Weasner, Brandon P Weasner, Kevin R Cook, Michael J Stinchfield, Shu Kondo, Kuniaki Saito, Justin P Kumar, Stuart J Newfeld
    • 雑誌名

      G3 (Bethesda, Md.)

      巻: 15 号: 3

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2020-12-16   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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