1. 前のページに戻る

メタゲノムビッグデータを活用した微生物の環境適応因子の解明

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 ACT-X

体系的番号 JPMJAX21BK
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJAX21BK

研究代表者

西村 陽介  東京大学, 大気海洋研究所, 特任研究員

研究期間 (年度) 2021 – 2023
概要微生物は地球上の様々な環境に対して、どのように適応し、進化してきたのでしょうか。本研究では、大規模メタゲノムデータを用いて環境横断的メタ解析を行うための情報学的手法を確立し、「遺伝子分布の環境特性」に関する網羅的な情報基盤を構築します。この知識リソースを活用して、微生物が持つ環境適応因子の全体像を解明するとともに、膨大な数の機能未知遺伝子から有用な遺伝子資源を探索するなどの応用研究に取り組みます。
研究領域環境とバイオテクノロジー

報告書

(4件)
  • 2023 事後評価書 ( PDF )   終了報告書 ( PDF )
  • 2022 年次報告書 ( PDF )
  • 2021 年次報告書 ( PDF )
  • 主な研究成果

    (2件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (2件) (国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Consensus statement from the first RdRp Summit: advancing RNA virus discovery at scale across communities2024

    • 著者名
      Justine Charon, Ingrida Olendraite, Marco Forgia, Li Chuin Chong, Luke S. Hillary, Simon Roux, Anne Kupczok, Humberto Debat, Shoichi Sakaguchi, Rachid Tahzima, So Nakagawa, Artem Babaian, Aare Abroi, Nicolas Bejerman, Karima Ben Mansour, Katherine Brown, Anamarija Butkovic, Amelia Cervera, Florian Charriat, Guowei Chen, Yuto Chiba, Lander De Coninck, Tatiana Demina, Guillermo Dominguez-Huerta, Jeremy Dubrulle, Serafin Gutierrez, Erin Harvey, Fhilmar Raj Jayaraj Mallika, Dimitris Karapliafis, Shen Jean Lim, Sunitha Manjari Kasibhatla, Jonathon C. O. Mifsud, Yosuke Nishimura, Ayda Susana Ortiz-Baez, Milica Raco, Ricardo Rivero, Sabrina Sadiq, Shahram Saghaei, James Emmanuel San, Hisham Mohammed Shaikh, Ella Tali Sieradzki, Matthew B. Sullivan, Yanni Sun, Michelle Wille, Yuri I. Wolf, Nikita Zrelovs, Uri Neri
    • 雑誌名

      Frontiers in Virology

      巻: 4

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cyanorhodopsin-II represents a yellow-absorbing proton-pumping rhodopsin clade within cyanobacteria2024

    • 著者名
      Masumi Hasegawa-Takano, Toshiaki Hosaka, Keiichi Kojima, Yosuke Nishimura, Marie Kurihara, Yu Nakajima, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Tomomi Kimura-Someya, Mikako Shirouzu, Yuki Sudo, Susumu Yoshizawa
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 18 号: 1

    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2022-05-09   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

サービス概要 よくある質問 利用規約

Powered by NII jst