野外トランスクリプトームの化学的制御手法の確立

研究課題

体系的番号	JPMJFR210B
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJFR210B
研究代表者	永野惇龍谷大学, 農学部, 教授
研究期間 (年度)	2022 – 2028 (予定)
概要	生物本来の生育場所であり、主たる農業生産の場でもある野外では、温度や光などが刻一刻と複雑に変化します。本研究では、独自の遺伝子発現予測技術と、大規模な環境制御、ケミカルトランスクリプトミクスを組み合わせることで、複雑な野外環境下における遺伝子発現の化学的制御を合理的に設計する技術の開発を目指します。この技術によって、野外における環境応答の分子機構の解明、その自在な制御につながることが期待されます。
研究領域	阿部パネル

報告書

(4件)

主な研究成果
(5件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (5件) (国際共著 2件、査読あり 5件、オープンアクセス 5件)

[雑誌論文] Reducing herbivory in mixed planting by genomic prediction of neighbor effects in the field2024
- 著者名
  Sato Y, Shimizu-Inatsugi R, Takeda K, Schmid B, Nagano AJ, Shimizu KK
- 雑誌名
  
  Nature Communications
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
[雑誌論文] Lasy-Seq: A High-Throughput 3' RNA-Seq Method for Large-Scale Transcriptome Profiling in Rice.2024
- 著者名
  Natsumi Mori-Moriyama, Atsushi J Nagano
- 雑誌名
  
  Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
  
  巻: 2869 ページ: 123-134
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] DeLTa-Seq: High-Throughput Targeted RNA-Seq of Rice Leaves Without RNA Purification.2024
- 著者名
  Makoto Kashima, Yasuyuki Nomura, Atsushi J Nagano
- 雑誌名
  
  Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
  
  巻: 2869 ページ: 113-121
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Simulation study of factors affecting the accuracy of transcriptome models under complex environments.2024
- 著者名
  Dan Eiju, Yoichi Hashida, Taro Maeda, Koji Iwayama, Atsushi J Nagano
- 雑誌名
  
  Plant molecular biology
  
  巻: 115 号: 2 ページ: 52-52
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Subgenome-informed statistical modeling of transcriptomes in 25 common wheat accessions reveals cis- and trans-regulation architectures.2024
- 著者名
  Yasuyuki Nomura, Moeko Okada, Toshiaki Tameshige, Shotaro Takenaka, Kentaro K Shimizu, Shuhei Nasuda, Atsushi J Nagano
- 雑誌名
  
  Plant & cell physiology
  
  巻: 66 号: 3 ページ: 347-357
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

野外トランスクリプトームの化学的制御手法の確立

研究代表者

永野 惇 龍谷大学, 農学部, 教授

報告書

主な研究成果

[雑誌論文] Reducing herbivory in mixed planting by genomic prediction of neighbor effects in the field2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Lasy-Seq: A High-Throughput 3' RNA-Seq Method for Large-Scale Transcriptome Profiling in Rice.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] DeLTa-Seq: High-Throughput Targeted RNA-Seq of Rice Leaves Without RNA Purification.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Simulation study of factors affecting the accuracy of transcriptome models under complex environments.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Subgenome-informed statistical modeling of transcriptomes in 25 common wheat accessions reveals cis- and trans-regulation architectures.2024

著者名

雑誌名

永野惇龍谷大学, 農学部, 教授