データ駆動型の次世代微生物進化育種

研究課題

体系的番号	JPMJCR21N2
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJCR21N2
研究代表者	石井純神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 准教授
研究期間 (年度)	2021 – 2026
概要	本研究では，in silico設計/in vitro選抜をパラレルに駆使したデータ駆動型の微生物人工進化論を構築します。そのために，ロボティクスを組み入れた独自の微生物構築／選抜・評価技術により実験データを可能な限り網羅的に取得し，計算機代謝モデルの設計精度の向上に取り組みます。最終的に，高度にファインチューンされた人工進化細胞の選抜法の確立と複雑な代謝統御原理の本質的な理解を目指します。
研究領域	データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新

主な研究成果
(4件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (4件) (国際共著 2件、査読あり 4件、オープンアクセス 4件)

[雑誌論文] Droplet-based microfluidic platform for detecting agonistic peptides that are self-secreted by yeast expressing a G-protein-coupled receptor.2024
- 著者名
  Ririka Asama, Cher J S Liu, Masahiro Tominaga, Yu-Ru Cheng, Yasuyuki Nakamura, Akihiko Kondo, Hsiang-Yu Wang, Jun Ishii
- 雑誌名
  
  Microbial cell factories
  
  巻: 23 号: 1 ページ: 104-104
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
[雑誌論文] Screening of protein-based inhibitors for the intracellular domain of epidermal growth factor receptor by directed evolution using the yeast Gγ recruitment system2024
- 著者名
  Ririka Asama, Masahiro Tominaga, Sayaka Ito, Yoichiro Ito, Kazuhiro Takemura, Shun Sakuraba, Kohei Katsurada, Nobuo Fukuda, Akihiko Kondo, Jun Ishii
- 雑誌名
  
  Journal of Bioscience and Bioengineering
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
[雑誌論文] Designing strong inducible synthetic promoters in yeasts.2024
- 著者名
  Masahiro Tominaga, Yoko Shima, Kenta Nozaki, Yoichiro Ito, Masataka Someda, Yuji Shoya, Noritaka Hashii, Chihiro Obata, Miho Matsumoto-Kitano, Kohei Suematsu, Tadashi Matsukawa, Keita Hosoya, Noriko Hashiba, Akihiko Kondo, Jun Ishii
- 雑誌名
  
  Nature communications
  
  巻: 15 号: 1 ページ: 10653-10653
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Production of borneol, camphor, and bornyl acetate using engineered Saccharomyces cerevisiae2024
- 著者名
  Masahiro Tominaga, Kazuma Kawakami, Hiro Ogawa, Tomomi Nakamura, Akihiko Kondo, Jun Ishii
- 雑誌名
  
  Metabolic Engineering Communications
  
  巻: 20
- 査読あり / オープンアクセス

データ駆動型の次世代微生物進化育種

研究代表者

石井 純 神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 准教授

主な研究成果

[雑誌論文] Droplet-based microfluidic platform for detecting agonistic peptides that are self-secreted by yeast expressing a G-protein-coupled receptor.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Screening of protein-based inhibitors for the intracellular domain of epidermal growth factor receptor by directed evolution using the yeast Gγ recruitment system2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Designing strong inducible synthetic promoters in yeasts.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Production of borneol, camphor, and bornyl acetate using engineered Saccharomyces cerevisiae2024

著者名

雑誌名

石井純神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 准教授