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統合的な転写制御データ基盤の構築

研究課題

知識インフラの構築 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム

体系的番号 JPMJND2202
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJND2202

研究代表者

粕川 雄也  理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー

研究期間 (年度) 2022 – 2026
概要転写制御の総合的理解をサポートするため、シスエレメント・トランス因子・エピゲノミクスデータを統合したデータ基盤INTRAREDを構築する。INTRAREDは同一染色体上で遺伝子の発現の調節に関わるゲノム中の領域であるシスエレメントについて、その領域や細胞の種類・状態毎のシスエレメント領域の活性状態を同定して収録したシスエレメントデータベースfanta.bioと、シスエレメントに結合するトランス因子や関連するエピゲノミクス情報を提供するChIP-Atlasで構成され、相互連携したビューを提供する。
研究領域統合化推進プログラム

報告書

(2件)
  • 2023 年次報告書 ( PDF )
  • 2022 年次報告書 ( PDF )

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2022-07-08   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2025-03-26  

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