異分野融合を志向した糖鎖科学ポータルのデータ拡充と品質向上

研究課題

体系的番号	JPMJND2204
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJND2204
研究代表者	木下聖子創価大学, 糖鎖生命システム融合研究所, 教授
研究期間 (年度)	2022 – 2026
概要	糖鎖科学情報と他のオミクス情報とを統合した「GlyCosmos Portal」を高度化し、微生物、植物、プロテオミクスなどとの異分野融合を推進する。具体的には、リポジトリシステムを拡充し、新規にレクチンマイクロアレイデータや微生物関連糖鎖情報および糖鎖関連パスウェイデータを受け入れる。また、リポジトリの登録データをキュレーションして公開する仕組みを構築する。
研究領域	統合化推進プログラム

報告書

(5件)

2024 中間報告書 ( PDF ) 中間評価書 ( PDF ) 年次報告書 ( PDF )
2023 年次報告書 ( PDF )
2022 年次報告書 ( PDF )

主な研究成果
(8件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (8件) (査読あり 1件)

[雑誌論文] Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features2024
- 著者名
  Shuya Ikeda, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Hirokazu Chiba, Susumu Goto, Masae Hosoda, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Tazro Ohta, Hiromasa Ono, Terue Takatsuki, Yasunori Yamamoto, Toshiaki Katayama
- 雑誌名
  
  Journal of Biomedical Semantics
  
  巻: 16 号: 1 ページ: 1-1
- DOI
  10.1186/s13326-024-00322-1
[雑誌論文] Updates implemented in version 4 of the GlyCosmos Glycoscience Portal2024
- 著者名
  Sunmyoung Lee, Tamiko Ono, Shiota Masaaki, Akihiro Fujita, Masaaki Matsubara, Achille Zappa, Issaku Yamada, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita
- 雑誌名
  
  Analytical and Bioanalytical Chemistry
  
  巻: 417 号: 5 ページ: 907-919
- DOI
  10.1007/s00216-024-05692-0
[雑誌論文] Cooperation of GlycoPOST and UniCarb-DR towards a comprehensive glycomics data repository workflow.2024
- 著者名
  Yushi Takahashi, Niclas G Karlsson, Shujiro Okuda, Kiyoko F Aoki-Kinoshita
- 雑誌名
  
  Analytical and bioanalytical chemistry
  
  巻: 417 号: 5 ページ: 1015-1023
- DOI
  10.1007/s00216-024-05673-3
[雑誌論文] Toward integration of glycan chemical databases: an algorithm and software tool for extracting sugars from chemical structures.2024
- 著者名
  Masaaki Matsubara, Evan E Bolton, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Issaku Yamada
- 雑誌名
  
  Analytical and bioanalytical chemistry
  
  巻: 417 号: 5 ページ: 945-956
- DOI
  10.1007/s00216-024-05508-1
[雑誌論文] Meeting report of the GlySpace Alliance and GaLSIC symposium.2024
- 著者名
  Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Frederique Lisacek, Raja Mazumder, Rene Ranzinger, Michael Tiemeyer, Issaku Yamada, Nicolle H Packer
- 雑誌名
  
  Glycobiology
  
  巻: 35 号: 5
- DOI
  10.1093/glycob/cwaf019
[雑誌論文] Updates implemented in version 4 of the GlyCosmos Glycoscience Portal.2024
- 著者名
  Sunmyoung Lee, Tamiko Ono, Shiota Masaaki, Akihiro Fujita, Masaaki Matsubara, Achille Zappa, Issaku Yamada, Kiyoko F Aoki-Kinoshita
- 雑誌名
  
  Analytical and bioanalytical chemistry
  
  巻: 417 号: 5 ページ: 907-919
- DOI
  10.1007/s00216-024-05692-0
[雑誌論文] MicroGlycoDB: A database of microbial glycans using Semantic Web technologies2024
- 著者名
  Sunmyoung Lee, Louis David Leclercq, Yann Guerardel, Christine M. Szymanski, Thomas Hurtaux, Tamara L. Doering, Takane Katayama, Kiyotaka Fujita, Kazuhiro Aoki, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita
- 雑誌名
  
  BBA Advances
  
  巻: 6 ページ: 100126-100126
- DOI
  10.1016/j.bbadva.2024.100126
- 査読あり
[雑誌論文] An N-glycome tissue atlas of 15 human normal and cancer tissue types determined by MALDI-imaging mass spectrometry.2024
- 著者名
  Elizabeth N Wallace, Connor A West, Colin T McDowell, Xiaowei Lu, Evelyn Bruner, Anand S Mehta, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Peggi M Angel, Richard R Drake
- 雑誌名
  
  Scientific reports
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 489-489
- DOI
  10.1038/s41598-023-50957-w

異分野融合を志向した糖鎖科学ポータルのデータ拡充と品質向上

研究代表者

木下 聖子 創価大学, 糖鎖生命システム融合研究所, 教授

報告書

主な研究成果

[雑誌論文] Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] Updates implemented in version 4 of the GlyCosmos Glycoscience Portal2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] Cooperation of GlycoPOST and UniCarb-DR towards a comprehensive glycomics data repository workflow.2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] Toward integration of glycan chemical databases: an algorithm and software tool for extracting sugars from chemical structures.2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] Meeting report of the GlySpace Alliance and GaLSIC symposium.2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] Updates implemented in version 4 of the GlyCosmos Glycoscience Portal.2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] MicroGlycoDB: A database of microbial glycans using Semantic Web technologies2024

著者名

雑誌名

DOI

[雑誌論文] An N-glycome tissue atlas of 15 human normal and cancer tissue types determined by MALDI-imaging mass spectrometry.2024

著者名

雑誌名

DOI

木下聖子創価大学, 糖鎖生命システム融合研究所, 教授