特異的分子認識場のデータ駆動型設計

研究課題

体系的番号	JPMJAX222I
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJAX222I
研究代表者	松長遼東京大学, 大学院工学系研究科, 助教
研究期間 (年度)	2022 – 2024
概要	抗体は生物が体内で自ら創り出す分子認識素子です。動物免疫を用いれば目的の抗体を取得できることが多く、これまで物理化学的観点で一から抗体が設計されることはありませんでした。一方で、標的に対して特異的に結合する低分子化合物は、物理化学的解析に基づいて設計されます。本研究では、この特異的低分子化合物設計方法から着想し、ハイスループットな物理化学的解析によるデータ駆動型の抗体設計方法の確立を目指します。
研究領域	生命現象と機能性物質

報告書

(2件)

2023 年次報告書 ( PDF )
2022 年次報告書 ( PDF )

主な研究成果
(5件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (5件) (国際共著 1件、査読あり 5件、オープンアクセス 5件)

[雑誌論文] Impact of single-residue mutations on protein thermal stability: The case of threonine 83 of BC2L-CN lectin.2024
- 著者名
  Megumi Hoya, Ryo Matsunaga, Satoru Nagatoishi, Teruhiko Ide, Daisuke Kuroda, Kouhei Tsumoto
- 雑誌名
  
  International journal of biological macromolecules
  
  巻: 272 ページ: 132682-132682
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] High‐throughput system for the thermostability analysis of proteins2024
- 著者名
  Sae Ito, Ryo Matsunaga, Makoto Nakakido, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Shumpei Ishikawa, Kouhei Tsumoto
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 33 号: 6 ページ: 1-12
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Unveiling the structural mechanisms behind high affinity and selectivity in phosphorylated epitope-specific rabbit antibodies2024
- 著者名
  Raiji Kawade, Daisuke Kuroda, Makoto Nakakido, Hiroki Akiba, Kevin Entzminger, Toshiaki Maruyama, Sigeru Okumura, Jose Manuel Martinez Caaveiro, Kouhei Tsumoto
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 300 号: 12 ページ: 107989
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
[雑誌論文] FASTIA: A rapid and accessible platform for protein variant interaction analysis demonstrated with a single‐domain antibody2024
- 著者名
  Ryo Matsunaga, Kouhei Tsumoto
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 34 号: 3 ページ: 1-8
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Affinity‐stability trade‐off mechanism of residue 35 in framework region 2 of VHH antibodies with β‐hairpin CDR32024
- 著者名
  Koichi Yamamoto, Satoru Nagatoishi, Ryo Matsunaga, Makoto Nakakido, Daisuke Kuroda, Kouhei Tsumoto
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 34 号: 4 ページ: 1-11
- 査読あり / オープンアクセス

特異的分子認識場のデータ駆動型設計

研究代表者

松長 遼 東京大学, 大学院工学系研究科, 助教

報告書

主な研究成果

[雑誌論文] Impact of single-residue mutations on protein thermal stability: The case of threonine 83 of BC2L-CN lectin.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] High‐throughput system for the thermostability analysis of proteins2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Unveiling the structural mechanisms behind high affinity and selectivity in phosphorylated epitope-specific rabbit antibodies2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] FASTIA: A rapid and accessible platform for protein variant interaction analysis demonstrated with a single‐domain antibody2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Affinity‐stability trade‐off mechanism of residue 35 in framework region 2 of VHH antibodies with β‐hairpin CDR32024

著者名

雑誌名

松長遼東京大学, 大学院工学系研究科, 助教