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生体環境からのAI駆動型1分子ナノポア計測法の開発

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 CREST

体系的番号 JPMJCR2231
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJCR2231

研究代表者

上村 想太郎  東京大学, 大学院理学系研究科, 教授

研究期間 (年度) 2022 – 2027
概要高感度でハイスループットなタンパク質網羅解析技術の開発は大きく遅れています。そこで、我々はナノポア計測と深層学習と統合させるシステムを開発し、生体環境からの対象分子を1分子定量網羅解析する系を確立します。深層学習を用いて特定分子のナノポア波形データを事前に学習し、各波形がどの事前学習分子に帰属されるかを特定することで、血液のような生体環境中においても網羅定量を可能にします。
研究領域社会課題解決を志向した革新的計測・解析システムの創出
  • 主な研究成果

    (2件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (2件) (査読あり 2件、 オープンアクセス 2件)

  • [雑誌論文] Nucleosomal DNA unwinding pathway through canonical and non-canonical histone disassembly2024

    • 著者名
      Hikaru Nozawa, Fritz Nagae, Satoshi Ogihara, Rina Hirano, Hirohito Yamazaki, Ryo Iizuka, Munetaka Akatsu, Tomoya Kujirai, Shoji Takada, Hitoshi Kurumizaka, Sotaro Uemura
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 7 号: 1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of novel fluorogenic RNA aptamers via in vitro compartmentalization using microbead-display libraries2024

    • 著者名
      Keisuke Ito, Tomotaka Tayama, Sotaro Uemura, Ryo Iizuka
    • 雑誌名

      Talanta

      巻: 278 ページ: 126488-126488

    • 査読あり / オープンアクセス

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JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2023-12-27   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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