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日本人塩基配列情報の公開可能なゲノム・オミクス情報基盤による双方向型研究教育データベース開発と国際連携

研究課題

知識インフラの構築 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム 育成型

体系的番号 JPMJND2302
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJND2302

研究代表者

長﨑 正朗  九州大学, 生体防御医学研究所 バイオメディカル情報解析分野, 教授

研究期間 (年度) 2023 – 2025
概要塩基配列レベルで公開可能な日本人約100サンプルをロングリードシーケンスによって決定した全ゲノム配列とそこから明らかになった構造多型情報、および該当サンプルのマルチオミクス情報を含むデータベースを中心に構築する。本データベースは、日本人における構造多型と希少疾患や多因子疾患との関連性を理解する上で重要な情報基盤となる。
研究領域統合推進プログラム(育成型)

報告書

(2件)
  • 2024 年次報告書 ( PDF )
  • 2023 年次報告書 ( PDF )
  • 主な研究成果

    (4件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (4件) (査読あり 4件)

  • [雑誌論文] LILR genotype imputation with attribute bagging (LIBAG): leukocyte immunoglobulin-like receptor copy number imputation system.2024

    • 著者名
      Seik-Soon Khor, Kouyuki Hirayasu, Yosuke Kawai, Hie Lim Kim, Masao Nagasaki, Katsushi Tokunaga
    • 雑誌名

      Frontiers in immunology

      巻: 16 ページ: 1559301-1559301

    • DOI

      10.3389/fimmu.2025.1559301

    • 査読あり
  • [雑誌論文] JoGo-LILR caller: Unveiling and navigating the complex diversity of LILRB3-LILRA6 copy number haplotype structures with whole-genome sequencing.2024

    • 著者名
      Masao Nagasaki, Kouyuki Hirayasu, Seik-Soon Khor, Ryoko Otokozawa, Yayoi Sekiya, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga
    • 雑誌名

      Human immunology

      巻: 86 号: 3 ページ: 111272-111272

    • DOI

      10.1016/j.humimm.2025.111272

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the hybrid gene LILRB5-3 by long-read sequencing and implication of its novel signalling function.2024

    • 著者名
      Kouyuki Hirayasu, Seik-Soon Khor, Yosuke Kawai, Mihoko Shimada, Yosuke Omae, Gen Hasegawa, Yuko Hashikawa, Hiromu Tanimoto, Jun Ohashi, Kazuyoshi Hosomichi, Atsushi Tajima, Hiroyuki Nakamura, Minoru Nakamura, Katsushi Tokunaga, Rikinari Hanayama, Masao Nagasaki
    • 雑誌名

      Frontiers in Immunology

      巻: 15

    • DOI

      10.3389/fimmu.2024.1398935

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetically Predicted Higher Levels of Caffeic Acid Are Protective Against Ulcerative Colitis: A Comprehensive Metabolome Analysis2024

    • 著者名
      Takeo Naito, Ryuya Osaka, Yoichi Kakuta, Yosuke Kawai, Seik-Soon Khor, Junji Umeno, Katsushi Tokunaga, NCBN Controls WGS Consortium, Hantsue Ishibashi-Ueda, Tsutomu Tomita, Michio Noguchi, Ayako Takahashi, Yu-ichi Goto, Sumiko Yoshida, Kotaro Hattori, Ryo Matsumura, Aritoshi Iida, Yutaka Maruoka, Hiroyuki Gatanaga, Masaya Sugiyama, Satoshi Suzuki, Kengo Miyo, Yoichi Matsubara, Akihiro Umezawa, Kenichiro Hata, Tadashi Kaname, Kouichi Ozaki, Haruhiko Tokuda, Hiroshi Watanabe, Shumpei Niida, Eisei Noiri, Koji Kitajima, Yosuke Omae, Reiko Miyahara, Hideyuki Shimanuki, Yosuke Kawai, Katsushi Tokunaga, Hiroshi Nagai, Yusuke Shimoyama, Rintaro Moroi, Hisashi Shiga, Masao Nagasaki, Yoshitaka Kinouchi, Atsushi Masamune
    • 雑誌名

      Inflammatory Bowel Diseases

    • DOI

      10.1093/ibd/izae143

    • 査読あり

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2023-12-27   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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