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生物情報アーカイブを活用した深層生成モデルによるmRNA最適設計技術

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 CREST

体系的番号 JPMJCR23N1
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJCR23N1

研究代表者

浅井 潔  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授

研究期間 (年度) 2023 – 2028
概要公開されている膨大な生物情報アーカイブと深層学習を活用し、実験量を大幅に削減したDBTLサイクルによって、タンパク質アミノ酸配列から望ましい性能をもつmRNAを自在に設計する技術を開発する。ウイルスワクチン、がんワクチン、遺伝子編集、タンパク質補充療法など医療応用に資する課題の中から設計すべきタンパク質を選び、mRNAを設計してその性能を測定し、技術の有効性を実証する。
研究領域データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新
  • 主な研究成果

    (6件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (6件) (査読あり 6件、 オープンアクセス 6件)

  • [雑誌論文] Development of hydrophobic tag purifying monophosphorylated RNA for chemical synthesis of capped mRNA and enzymatic synthesis of circular mRNA2024

    • 著者名
      Mami Ototake, Masahito Inagaki, Seigo Kimura, Kaoru Onda, Mizuki Tada, Daisuke Kawaguchi, Hirotaka Murase, Kosuke Fukuchi, Yinuo Gao, Kengo Kokubo, Susit Acharyya, Zheyu Meng, Tatsuma Ishida, Tairin Kawasaki, Naoko Abe, Fumitaka Hashiya, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      NUCLEIC ACIDS RESEARCH

      巻: 52 号: 20 ページ: 12141-12157

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Concise Affinity-Based Purification of Ligated mRNA for Structure-Activity Relationship Studies of Nucleosugar Modification Patterns2024

    • 著者名
      Hiroki Yamada, Hiroto Iwai, Fumitaka Hashiya, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe, Junichiro Yamamoto
    • 雑誌名

      CHEMBIOCHEM

      巻: 26 号: 2

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Consistent features observed in structural probing data of eukaryotic RNAs2024

    • 著者名
      Kazuteru Yamamura, Kiyoshi Asai, Junichi Iwakiri
    • 雑誌名

      NAR Genomics and Bioinformatics

      巻: 7 号: 1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Synthesis of hydrophobic-tagged 2′-deoxy-modified cap analogs and its effect on mRNA translation2024

    • 著者名
      Zheyu Meng, Yuko Nakashima, Masahito Inagaki, Zhenmin Li, Susit Acharyya, Fumitaka Hashiya, Naoko Abe, Yasuaki Kimura, Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      巻: 98 号: 2

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Internal cap-initiated translation for efficient protein production from circular mRNA2024

    • 著者名
      Kosuke Fukuchi, Yuko Nakashima, Naoko Abe, Seigo Kimura, Fumitaka Hashiya, Yuichi Shichino, Yiwei Liu, Ryoko Ogisu, Satomi Sugiyama, Daisuke Kawaguchi, Masahito Inagaki, Zheyu Meng, Shiryu Kajihara, Mizuki Tada, Satoshi Uchida, Ting-Ting Li, Ramkrishna Maity, Tairin Kawasaki, Yasuaki Kimura, Shintaro Iwasaki, Hiroshi Abe
    • 雑誌名

      NATURE BIOTECHNOLOGY

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] RNA secondary structure prediction by conducting multi-class classifications2024

    • 著者名
      Jiyuan Yang, Kengo Sato, Martin Loza, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 27 ページ: 1449-1459

    • 査読あり / オープンアクセス

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JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2023-12-27   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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