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集積化DNAオリガミナノポアによるトランスクリプトームシーケンシングの開発

研究課題

戦略的な研究開発の推進 経済安全保障重要技術育成プログラム

体系的番号 JPMJKP23H4
DOI https://doi.org/10.52926/JPMJKP23H4

研究代表者

ナマシヴァヤム パンディアン  京都大学, 高等研究院物質―細胞統合システム拠, 主任研究員 講師

研究期間 (年度) 2023 – 2028 (予定)
概要RNAの構造情報と配列情報を確実に読み出すための迅速な生体分子シーケンシング技術の開発に取り組みます。DNAオリガミで形成される空間にナノポアを包含した“DNAオリガミナノポア”を使ったシーケンシング法(NanORI-Seq)を開発し、多様なRNA修飾や高次構造の検出と配列の同時読み出しを行います。これを基盤に、最先端のマイクロ流体チャンネルを備えた統合型NanORI-Seq搭載デバイスの開発を目指します。
研究領域「生体分子シークエンサー等の先端研究分析機器・技術」に関する研究開発構想(個別研究型)

報告書

(1件)
  • 2024 年次報告書 ( PDF )
  • 主な研究成果

    (2件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (2件) (国際共著 2件、 査読あり 2件)

  • [雑誌論文] Biomass-derived carbon dots as fluorescent quantum probes to visualize and modulate inflammation2024

    • 著者名
      Mahima Kumar, Shanmugavel Chinnathambi, Noremylia Bakhori, Norhidayah Abu, Fatemeh Etezadi, Vaijayanthi Thangavel, Daniel Packwood, Easan Sivaniah, Ganesh N. Pandian
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 14 号: - ページ: 12665--

    • DOI

      10.1038/s41598-024-62901-7

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular design for cardiac cell differentiation using a small dataset and decorated shape features2024

    • 著者名
      F. Etezadi, S. Ito, K. Yasui, R. K.Abdalkader, I.Minami, M. Uesugi, Ganesh N Pandian, H. Nakano, A.i Nakano, D. M. Packwood
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 64 号: 23 ページ: 8824-8837

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.4c01353

    • 査読あり / 国際共著

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2025-03-26   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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