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エピゲノムゆらぎによる細胞状態の離散境界における確率的遷移過程の推定

研究課題

戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 ACT-X

体系的番号 JPMJAX24L5

研究代表者

河口 理紗  東京大学, 大学院薬学系研究科, 准教授

研究期間 (年度) 2024 – 2027
概要私が着目しているのは、細胞ごとに見られるエピゲノム状態のゆらぎを生み出す仕組みと、そこから引き起こされる細胞状態遷移の確率性の理解です。一細胞エピゲノム解析における網羅性・深度などのバイアス問題を深層学習モデルによって克服し、細胞の初期化や分化などの細胞遷移の過程で、様々な外的な力により生み出されるエピゲノム変化(ひずみ)が、確率的に細胞を遷移させる過程を説明する物理モデルの構築を目指します。
研究領域生命と情報
  • 主な研究成果

    (1件)

すべて 2024

すべて 雑誌論文 (1件) (国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] A feedback amplifier circuit with Notch and E2A orchestrates T-cell fate and suppresses the innate lymphoid cell lineages during thymic ontogeny.2024

    • 著者名
      Kazuko Miyazaki, Kenta Horie, Hitomi Watanabe, Reiko Hidaka, Rinako Hayashi, Norihito Hayatsu, Kentaro Fujiwara, Rei Kuwata, Takuya Uehata, Yotaro Ochi, Makoto Takenaka, Risa Karakida Kawaguchi, Koichi Ikuta, Osamu Takeuchi, Seishi Ogawa, Katsuto Hozumi, Georg A Hollander, Gen Kondoh, Taishin Akiyama, Masaki Miyazaki
    • 雑誌名

      Genes & development

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

URL: 

JSTプロジェクトデータベース掲載開始日: 2026-01-14   JSTプロジェクトデータベース最終更新日: 2026-09-08  

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