１細胞データ科学を介した融合数理の革新

研究課題

体系的番号	JPMJCR24Q1
DOI	https://doi.org/10.52926/JPMJCR24Q1
研究代表者	井元佑介京都大学, 高等研究院, 特定准教授
研究期間 (年度)	2024 – 2029
概要	本研究は、数学・生命科学の本格的な融合研究を通じて、近年、世界中で爆発的に収集されている１細胞データから、高次元統計解析、関数空間論、トポロジーなどの高次元空間を扱う多角的な数学理論に基づき、細胞分化の制御メカニズムをゲノム・エピゲノム分子レベルで特定するデータ解析基盤技術を創出します。さらに、その数理基盤技術を諸分野のビッグデータ解析へ展開し、応用数学の可能性を拡げることを目指します。
研究領域	予測・制御のための数理科学的基盤の創出

主な研究成果
(7件)

すべて 2024

すべて雑誌論文 (7件) (オープンアクセス 7件、査読あり 6件)

[雑誌論文] 超双対数に基づく高階微分計算手法の開発と応用2024
- 著者名
  井元佑介
- 雑誌名
  
  応用数理
  
  巻: 34 号: 4 ページ: 23-33
- オープンアクセス
[雑誌論文] 高次元統計解析で探る銀河の分子ガスの物理状態と天文学への展望2024
- 著者名
  竹内努，矢田和善，江頭健斗，青嶋誠，吉川耕司，石井晶，加納龍生，施文，曹愛奈，馬海霞，松井瀬奈，中西康一郎，クレスチェータ，河野孝太郎
- 雑誌名
  
  統計数理
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Defects in the H3t Gene Cause an Increase in Leydig Cells With Impaired Spermatogenesis in Mice.2024
- 著者名
  Qianmei Wu, Miho Ito, Takeru Fujii, Kaori Tanaka, Kohta Nakatani, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Takashi Baba, Kazumitsu Maehara, Kosuke Tomimatsu, Tatsuya Takemoto, Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] scEGOT: single-cell trajectory inference framework based on entropic Gaussian mixture optimal transport2024
- 著者名
  Toshiaki Yachimura, Hanbo Wang, Yusuke Imoto, Momoko Yoshida, Sohei Tasaki, Yoji Kojima, Yukihiro Yabuta, Mitinori Saitou, Yasuaki Hiraoka
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 25 号: 1
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Proposing a low-rank approximation method with mathematical guarantees for high-dimensional tensor data2024
- 著者名
  Hiroki Hasegawa, Kazuyoshi Yata, Yukihiko Okada, Jun Kunimatsu
- 雑誌名
  
  2024 IEEE International Conference on Big Data
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] The balance between IFN-γ and ERK/MAPK signaling activities ensures lifelong maintenance of intestinal stem cells2024
- 著者名
  May Nakajima-Koyama, Mio Kabata, Joonseong Lee, Yuko Sogabe, Satoko Sakurai, Akira Hirota, Mizuki Kimura, Tomonori Nakamura, Yusuke Imoto, Kohei Kometani, Yoko Hamazaki, Yasuaki Hiraoka, Mitinori Saitou, Eisuke Nishida, Takuya Yamamoto
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  ページ: 115286-115286
- 査読あり / オープンアクセス
[雑誌論文] Single-cell multiomic analysis revealed the differentiation, localization, and heterogeneity of IL10+ Foxp3--follicular T cells in humans2024
- 著者名
  Shusei Fujioka, Mayu Fujioka, Yusuke Imoto, Yasuyo Harada, Hiroyuki Yoshitomi, Masato Kubo, Yasuaki Hiraoka, Hideki Ueno
- 雑誌名
  
  International Immunology
- 査読あり / オープンアクセス

１細胞データ科学を介した融合数理の革新

研究代表者

井元 佑介 京都大学, 高等研究院, 特定准教授

主な研究成果

[雑誌論文] 超双対数に基づく高階微分計算手法の開発と応用2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] 高次元統計解析で探る銀河の分子ガスの物理状態と天文学への展望2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Defects in the H3t Gene Cause an Increase in Leydig Cells With Impaired Spermatogenesis in Mice.2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] scEGOT: single-cell trajectory inference framework based on entropic Gaussian mixture optimal transport2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Proposing a low-rank approximation method with mathematical guarantees for high-dimensional tensor data2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] The balance between IFN-γ and ERK/MAPK signaling activities ensures lifelong maintenance of intestinal stem cells2024

著者名

雑誌名

[雑誌論文] Single-cell multiomic analysis revealed the differentiation, localization, and heterogeneity of IL10+ Foxp3--follicular T cells in humans2024

著者名

雑誌名

井元佑介京都大学, 高等研究院, 特定准教授